Boost + Memcache + APC 不会冲突。

Boost静态页面缓存，Memcache作为Drupal的backend缓存，APC作为PHP的OPcode缓存，都是非常合理的。

不过感觉你的站点登录用户比较多，所以，个人建议不要用Boost，因为Boost只是匿名用户缓存，想给登录用户使用，修改的非常多，并且作为电子商务站点，不适合。

推荐使用authcache，authcache模块可以给登录用使用，当然，额外注意：authcache也可以对匿名用户缓存。并且authcache有对用户信息局部化处理的模块，你可以试一下。

关于autchcache模块，可以在《Drupal大学》里面搜索相关讨论，或许能有帮助，另外《Drupal与高性能网站架构》里面也有几篇关于authcache的帖子，推荐阅读一下。

匿名用户使用Boost完全没有问题，但如果想对登录用户也缓存会极大的增加网站的复杂度和开发实践，建议先用Boost，直到你明确之后Boost不够你用的。