Drupal论坛的解决方案：

https://www.drupal.org/node/1329872#comment-6748096

问题的本质是node-index的时候node_load找不到node，就是下面这个函数，可以加个判读，判断node是否存在。

function _node_index_node($node) {
  $node = node_load($node->nid);

  ///////添加在这里
  if (!$node) return;
  
  // Save the changed time of the most recent indexed node, for the search
  // results half-life calculation.
  variable_set('node_cron_last', $node->changed);

  // Render the node.
  $build = node_view($node, 'search_index');
  unset($build['#theme']);
  $node->rendered = drupal_render($build);

  $text = '<h1>' . check_plain($node->title) . '</h1>' . $node->rendered;

  // Fetch extra data normally not visible
  $extra = module_invoke_all('node_update_index', $node);
  foreach ($extra as $t) {
    $text .= $t;
  }

  // Update index
  search_index($node->nid, 'node', $text);
}

这个问题的主要原因是node数据的不完善，因为node_load至少有一个node revision，没有的就load不到，所以可以找到哪些不完善的node，然后删掉这些node，通过下面的sql：

SELECT nid FROM node WHERE nid NOT IN (SELECT nid FROM node_revision);